Пономарева — деревня Большешальского общества Лодыгинской волости Каргопольского уезда. Стан 3-й. Находится при колодцах (1873) / при ручьях и колодцах (1905). Лежит на Шенкурской проселочной дороге, от города Каргополя до границы Шенкурского уезда.
Расстояние до уездного города (Каргополь) — 12 вёрст*, до становой квартиры — 59 вёрст*. Стан 3-й. Местоположение становой квартиры — Андреевская. Расстояние до волостного правления (Кустова) — 5 вёрст. До ближайшей деревни или села 1 верста. До отделения почты 12 вёрст. До школы 3.5 вёрст.
Согласно «Списку населённых мест» 1873 года, население составляло 70 человек: 33 мужчин и 37 женщин. Жили по 11 дворам. Часовня православная.
В «Списке населённых мест» 1905 года название деревни — Пономарева. Население к 1905 году состояло из 73 крестьянок и 55 крестьян. Всего 128 человек. Дворов 21, семей 23. Имелся скот: 23 лошади, 33 коровы и 55 голов прочего скота.
За 32 года между составлением списков 1873 и 1905 годов количество дворов увеличилось на 10 (+90.91%), мужчин стало больше на 22 (+66.67%) и женщин стало больше на 36 (+97.3%). Общая численность населения увеличилась на 58 человек (+82.86%)